Joensuun Puhallinorkesterin hallinnosta vastaa Joensuun Puhallinorkesteriyhdistys ry. Yhdistyksessä on noin 75 jäsentä, muun muassa orkesterin nykyisiä ja entisiä aktiivisoittajia sekä muita puhallinmusiikista kiinnostuneita. Yhdistyksen vuosikokous pidetään helmikuussa. Käytännön asioita yhdistyksessä hoitaa vuosikokouksen valitsema johtokunta, joka koostuu puheenjohtajasta sekä neljästä varsinaisesta ja kahdesta varajäsenestä.
Joensuun Puhallinorkesteriyhdistys ry
Osoite: PL 225, 80101 Joensuu
Puhelin: 0500 139 750 (puheenjohtaja Erkki Kettunen)
Rekisterinumero: 123 860
Y-tunnus: Y-0218908-9
Tilinumero: Nordea FI19 2016 1800 0192 22
Yhdistys perustettu 1976 (orkesterin perustamisvuosi 1964)