Joensuun Puhallinorkesterin hallinnosta, toiminnan suunnittelusta ja käytännön asioiden hoidosta vastaa yhdistyksen vuosikokouksen valitsema johtokunta. Siihen kuuluu puheenjohtaja sekä neljä varsinaista ja kaksi varajäsentä. Jäsenten toimikausi on kaksi vuotta siten, että puolet heistä on kunakin vuonna erovuorossa. Myös orkesterin kapellimestari osallistuu johtokunnan toimintaan.
Joensuun Puhallinorkesteriyhdistys ry:n johtokunta vuonna 2024:
Puheenjohtaja Erkki Kettunen, 0500 139 750
Sihteeri Annikki Tanskanen, 050 414 3475
Kapellimestari Mika Hirvonen, 050 556 5221
Muut jäsenet
Varapuheenjohtaja Maria Aukee
Arto Matikainen
Kaisa Tanskanen
Maria Sorsa
Johtokunnan varajäsenet
Anna Dannenberg
